本署執行資通安全作業有功人員，依「財政部國有財產署及所屬機關人員獎懲作業規定」及約用人員相關規定辦理。 

本署人員違反資通安全規定者，依「財政部國有財產署及所屬機關人員獎懲作業規定」及約用人員相關規定辦理；有「公務員懲戒法」第 2 條所定情事，應付懲戒者，依該法第 19 條規定辦理；有觸犯「刑法」之嫌疑者，應予移送司法機關調查；有涉及國家賠償事件者，應依「國家賠償法」等相關法律追究損害賠償責任。 

非本署人員違反資通安全規定時，依相關法律規定追究民刑事責任。